Acetylcholín pôsobí v centrálnom nervovom systéme (CNS) aj v periférnom nervovom systéme (PNS). V CNS podporuje cholinergné signály z bazálneho predného mozgu do mozgovej kôry a hipokampu a kognitívne funkcie týchto cieľových oblastí. V PNS je acetylcholín hlavným prenášačom nervových vzruchov do svalov → neurotransmiterom.
Keď motorický neurón vygeneruje akčný potenciál, rýchlo sa pohybuje pozdĺž nervu, až kým nedosiahne neuromuskulárne spojenie, kde spustí elektrochemický proces, ktorý spôsobí uvoľnenie acetylcholínu do priestoru medzi presynaptickým zakončením a svalovým vláknom. Molekuly acetylcholínu sa potom viažu na receptory nikotínových iónových kanálov na membráne svalových buniek, čo spôsobí otvorenie iónových kanálov. Ióny sodíka potom prúdia do svalovej bunky a spúšťajú postupnosť krokov, ktoré nakoniec vyvolajú svalovú kontrakciu .